夏秋之交，在中国古代医学中，被称为长夏，长夏季节，很容易发生腹泻。《黄帝内经》的《金匮真言论篇第四》中有言：“故春善病鼽衄，仲夏善病胸肋，长夏善病洞泄寒中，秋善病风疟，冬善病痹厥”。这说明从古至今，人们就已经注意到夏秋之交很容易发生腹泻的现象。
长夏季节为什么这么容易发生腹泻呢？这主要是因为这个季节影响肠道的微生物很活跃，霍乱、细菌性肠炎、病毒性肠炎等均易发生在长夏季节。据WHO不完全统计，全世界每年感染性腹泻病例达30-50亿人次，仅5岁以下儿童每年发生感染性腹泻就有约18亿人次，其中300多万人死亡，腹泻时5岁以下儿童的首位疾病和死因，夏秋季节最为多见。
俗话说的小儿秋季腹泻，多数是因为轮状病毒导致的病毒性肠炎，这种病毒性肠炎如果处置不及时，常会导致小儿死亡。轮状病毒共分为A-G七个组，其中的A、B、C三组可感染人和动物，其余四组只能感染动物。轮状病毒腹泻主要发生在秋季和冬季，无论卫生条件好坏，几乎所有5岁以上的儿童都感染过A组人轮状病毒。轮状病毒除引起腹泻外，还会导致患者出现发烧和呕吐等症状。
除轮状病毒外，诺如病毒也是会引起腹泻的一种常见病毒。诺如病毒常常会引爆聚集性疫情。诺如病毒既无疫苗，亦无特效药物，人群普遍易感，而且一年四季都容易爆发诺如病毒疫情，只是夏秋季节尤其高发而已。
霍乱，细菌性腹泻和痢疾的发病高峰一般也是在夏秋季节。霍乱是由霍乱杆菌引起的，霍乱作为甲级传染病，其杀伤力非同小可。大肠杆菌、痢疾杆菌等病原微生物也是在夏秋季节猖獗。
一般认为这个季节之所以高发各种病原微生物引起的腹泻，可能与生活方式及饮食习惯有关。因为以上的病原微生物都是以“粪-口”传播为主。夏秋季节自然界水体受污染机会增多，苍蝇等媒介生物大量繁殖，加上人们喜欢在这个季节食用各种生冷食材，导致这些病毒和细菌传播机会大大增加。
除霍乱外，多数在夏秋季节传播的病毒和细菌造成的腹泻都是自限性疾病，而霍乱则是被世界各国严密监控的甲级传染病，在现有的医疗条件下，不再容易爆发大规模的霍乱疫情。所以身体壮实的人，在夏秋之交不易发生腹泻或即便发生腹泻，情况也不太严重。
但是免疫力低下的人群，如儿童和一些慢性病患者，则应注意，要尽量堵截住各种粪口传播的病原微生物的侵袭。不但要避免食用生冷食品，而且餐具和炊具也要做好高温消毒工作，家中还要做好灭蝇和灭蟑工作，菜要煮熟煮透才能吃，洗菜的器具尽量与餐具分开洗。
公共卫生间里的门把手和气溶胶也能传播各种可导致腹泻的病毒和细菌，使用公共卫生间时也要做好个人防护。因为很多病原微生物都属于人畜共染的，所以常见的宠物和家禽、家畜，也是重要的传染源。与动物接触或接触动物粪便时，都要注意个人卫生。
由于长期以来，受中医的传统理念的影响，多数中国人在出现大便溏泄时，想到的不是病原微生物，而是“脾虚”等字眼。所以很容易按照健脾的思路滥用药和乱投医，也很容易对导致腹泻的传染源疏忽大意，反复感染病毒和细菌。而有些有害病菌，如产气荚膜杆菌，绿脓杆菌等，一旦侵入人的肠道，能够长期盘踞在肠道之中，大量繁殖，导致患者反复腹胀、腹痛和腹泻。所以很多人是长期被腹胀和腹泻等问题困扰。
自从抗生素出现后，人类普遍的使用过抗生素，但是滥用抗生素后，也会导致肠道的有益菌被大量的杀死，出现抗生素引起的腹泻。所以在追查患者的腹泻病因时，也要考虑滥用抗生素的因素。
因为夏秋之交的腹泻的病因复杂，所以西医治疗这一季节的腹泻，还是要先明确病因，确定所感染的病原微生物的种类。而中医则多是采用对症治疗的方法，需要医生根据患者的各种症状，对症用药。
但治病不如防病，患者自己守住口，勤洗手，不滥用药很重要。健康的生活方式和卫生习惯，可以大大的减少罹患夏秋季节的腹泻的概率。